生物工程專業(yè)2011年并入化學類（輕化工類）進行招生。
本專業(yè)是建立在原北京輕工業(yè)學院1958年創(chuàng)建的國內最早的發(fā)酵工程專業(yè)基礎上，1984年改建為生物化工專業(yè)（包括發(fā)酵工程和食品工程兩個方向）。1998年根據全國本科專業(yè)目錄修訂，生物化工專業(yè)調整為生物工程專業(yè)，具有生物化工碩士學位授予權。生物工程是當代高科技的主要領域之一，生物工程綜合技術已被普遍認為是人類21世紀徹底解決人口、資源、環(huán)境三大危機，實現可持續(xù)發(fā)展的有效途徑之一。結合本校輕工行業(yè)的學科特色，本專業(yè)注重生物技術在食品工業(yè)、輕化工資源綜合利用方面的應用，在天然植物生物活性成分的提取分離、果蔬食品的生物保鮮儲藏、功能性食品配料的研發(fā)、傳統(tǒng)發(fā)酵技術、化妝品生物技術等方面有特色。本專業(yè)研究生招生方向有：食品生物技術，生物分離工程，化妝品生物技術。
本專業(yè)具有較強教師隊伍，有專任教師14人，其中教授4人，副教授5人，北京市科技新星3人，博士/博士后占85.7%。近五年承擔“973”、“863”、國家“十一五”科技支撐計劃、國家自然科學基金、北京市自然科學基金等國家/省部級科研項目及企業(yè)委托項目50余項，自籌到位經費800余萬元，發(fā)表論文100余篇，出版專著7部，獲國家發(fā)明專利20余項。
本專業(yè)依托北京市植物資源研究開發(fā)重點實驗室平臺，擁有微生物鑒定儀、超速冷凍離心機、正置顯微鏡、倒置顯微鏡、紫外和熒光酶標、細胞計數儀、基因擴增儀、液-質聯(lián)用儀、氣-質聯(lián)用儀、高效凝膠色譜儀、逆流色譜儀等現代化生物儀器設備。為學生創(chuàng)新實踐提供了一個良好的平臺。
主要課程：無機化學、有機化學、物理化學、分析化學（含儀器分析）、化工原理、生物化學、微生物學、細胞生物學、分子生物學、基因工程、發(fā)酵工程及產品、生物分離工程、酶工程、生物工程設備、生物制品質量分析等。
部分就業(yè)單位：本專業(yè)以“厚基礎、寬口徑、重實踐”為指導思想，培養(yǎng)既具備系統(tǒng)生物學理論基礎，又掌握現代應用生物技術的綜合性工程技術人才。畢業(yè)學既可報考理科生物類、又可報考工科類生物工程和食品科學與工程等專業(yè)研究生。就業(yè)范圍廣泛，畢業(yè)生能勝任生物醫(yī)藥、輕工食品、化妝品、衛(wèi)生檢驗檢疫、農副產品、生態(tài)環(huán)保等領域的企事業(yè)單位的工作。主要就業(yè)單位有寶潔(中國)有限公司，諾維信(中國)投資有限公司，北京市理化分析測試中心，上海市醫(yī)藥工業(yè)研究院，北京日用化學研究所，桂林南藥股份有限公司，燕京啤酒集團，青島啤酒集團，北京雙鶴藥業(yè)，北京牛欄山酒廠，北京龍徽葡萄酒廠，北京三元乳品廠、北京順鑫農業(yè)集團、北京市和田寬釀造公司、北京市王致和釀造食品集團等。
學生畢業(yè)直接考取研究生的單位：中國科學院、軍事醫(yī)學科學研究院、中國農業(yè)科學研究科院、中國環(huán)境科學研究院、北京大學、清華大學、天津大學、武漢大學、浙江大學、中山大學、四川大學、北京理工大學、華東理工大學、華中農業(yè)大學、江南大學、北京化工大學、華南師范大學、首都師范大學、北京林業(yè)大學、北京科技大學等。
